單細(xì)胞RNA-seq揭示活化蛋白C對(duì)阿爾茨海默病的轉(zhuǎn)錄組調(diào)節(jié)

一篇新的研究論文發(fā)表在Aging (MEDLINE/PubMed列出的“Aging (Albany NY)”和Web of Science列出的“Aging- us”)第16卷第4期，題為“單細(xì)胞RNA-seq揭示了活化蛋白c對(duì)阿爾茨海默病的轉(zhuǎn)錄組調(diào)節(jié)”。

單細(xì)胞RNA測(cè)序揭示了阿爾茨海默病(AD)模型5xFAD (5x家族性AD突變)與野生型(WT)小鼠細(xì)胞群的變化。在這項(xiàng)新的研究中，來(lái)自南佛羅里達(dá)大學(xué)、密西西比大學(xué)醫(yī)學(xué)中心和G.V. (Sonny) Montgomery VA醫(yī)學(xué)中心的研究人員Mohammad Kasim Fatmi、Wang Hao、Lily Slotabec、Changhong Wen、Blaise Seale、Bi Zhao和Ji Li使用單細(xì)胞RNA測(cè)序和生物信息學(xué)分析分析了APC [Activated Protein C]治療對(duì)AD轉(zhuǎn)基因小鼠的影響。

“在我們的研究中，我們使用了含有五種主要淀粉樣蛋白病理表達(dá)的轉(zhuǎn)基因小鼠，這些淀粉樣蛋白病理允許AD和Aβ沉積的快速進(jìn)展，被稱為5xFAD小鼠。”

返回的測(cè)序數(shù)據(jù)通過(guò)10x Genomics CellRanger平臺(tái)進(jìn)行比對(duì)，形成相應(yīng)的矩陣進(jìn)行生物信息學(xué)分析。與WT相比，5xFAD的神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞發(fā)生了改變，尤其是小膠質(zhì)細(xì)胞的增殖在5xFAD中明顯增加。5xFAD與WT的膠質(zhì)細(xì)胞差異表達(dá)檢測(cè)揭示了基因調(diào)控。在全球范圍內(nèi)，與AD進(jìn)展相關(guān)的關(guān)鍵基因如Apoe、Ctsb、Trem2和Tyrobp上調(diào)。

利用這些差異表達(dá)數(shù)據(jù)，我們完成了氧化石墨烯項(xiàng)富集，以觀察AD進(jìn)展可能影響的生物學(xué)過(guò)程。利用抗炎和細(xì)胞保護(hù)重組活化蛋白C (APC)，研究人員發(fā)現(xiàn)，除了恢復(fù)神經(jīng)系統(tǒng)過(guò)程外，APC治療還下調(diào)了炎癥過(guò)程。此外，動(dòng)物研究表明，重組APC可顯著減輕5xFAD小鼠的Aβ負(fù)荷，改善其認(rèn)知功能。

“在5xFAD中，高表達(dá)的AD生物標(biāo)志物的下調(diào)可以為APC治療對(duì)AD有益的機(jī)制提供見解。”

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