一個(gè)全面的蛋白質(zhì)基因組數(shù)據(jù)集幫助癌癥研究人員解開(kāi)分子之謎

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發(fā)表時(shí)間:2023-08-16 16:15

美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院正在發(fā)布一個(gè)全面的數(shù)據(jù)集,該數(shù)據(jù)集標(biāo)準(zhǔn)化了來(lái)自10種癌癥類(lèi)型的1000多種腫瘤的個(gè)體研究的基因組、蛋白質(zhì)組學(xué)、成像和臨床數(shù)據(jù)。來(lái)自世界各地的研究人員將能夠利用這一公開(kāi)可用的資源,揭示癌癥如何發(fā)展和進(jìn)展的新的分子見(jiàn)解。該數(shù)據(jù)集由美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院下屬的美國(guó)國(guó)家癌癥研究所的臨床蛋白質(zhì)組學(xué)腫瘤分析聯(lián)盟(CPTAC)生成

發(fā)表在《Cancer Cell》雜志上的一篇論文描述了泛癌癥蛋白質(zhì)基因組數(shù)據(jù)集,它建立在蛋白質(zhì)組學(xué)科學(xué)幾十年的技術(shù)進(jìn)步的基礎(chǔ)上。該數(shù)據(jù)集的發(fā)布支持了拜登-哈里斯政府通過(guò)改進(jìn)數(shù)據(jù)共享加速癌癥研究的“癌癥登月計(jì)劃”目標(biāo)。

CPTAC研究人員在《Cell》雜志上發(fā)表的另外兩篇研究論文初步證明了該數(shù)據(jù)集作為科學(xué)發(fā)現(xiàn)的寶貴資源的潛力。在**篇論文中,多組學(xué)分析用于將癌癥驅(qū)動(dòng)突變與蛋白質(zhì)模式聯(lián)系起來(lái)。第二篇論文深入研究了調(diào)節(jié)細(xì)胞信號(hào)和生理的蛋白質(zhì)修飾,以顯示與不同腫瘤類(lèi)型的DNA修復(fù),代謝和免疫的關(guān)聯(lián)。

泛癌癥蛋白質(zhì)基因組數(shù)據(jù)集將通過(guò)NCI癌癥研究數(shù)據(jù)共享庫(kù)公開(kāi)提供。蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)可以通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)共享訪問(wèn)。基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)可以通過(guò)基因組數(shù)據(jù)共享和癌癥數(shù)據(jù)服務(wù)訪問(wèn)。



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